Esta línea de investigación analiza la ecología del resistoma acuático en aguas naturales y urbanas, estudiando la presencia y diseminación de bacterias resistentes a los antibióticos y los factores que la condicionan. Mediante técnicas como la genómica, la metagenómica y la epidemiología basada en aguas residuales, se explora el papel de las aguas como reservorios de genes de resistencia. El objetivo es comprender el impacto de los estreses ecológicos y antropogénicos en la resistencia a los antibióticos y contribuir a su control siguiendo el enfoque One Health.