La recerca a la línia Processos hidrològics i recursos hídrics versa sobre la disponibilitat de recurs hídric -o millor, escassetat del recurs- en les condicions actuals i en els futurs escenaris climàtics, considerant les necessitats d’abastament i les dels ecosistemes. Els estudis s’adrecen a la disponibilitat i qualitat dels recursos d’aigua subterrània. En els aspectes qualitatius, es contemplen els casos concrets de contaminació de nitrats i per contaminants emergents de diferents orígens, amb la intenció d’entendre els processos de transport en el subsol i aportar criteris de mitigació de la contaminació i preservació de al qualitat del recurs.